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今年２月に入社した社員がいます。
１月については、少々の収入があるようですが、
明細や資料となるものは何もないそうです。
一応、農業の収入もあるとのことで、毎年自分で確定申告しているそうです。

この場合、当社では２月から１２月までの分で年末調整をすればいいのでしょうか？本人は、今年も確定申告をします、と言っているのですが。
よろしくお願いいたします。

今年２月に入社した社員がいます。
１月については、少々の収入があるようですが、
明細や資料となるものは何もないそうです。
一応、農業の収入もあるとのことで、毎年自分で確定申告しているそうです。

この場合、当社では２月から１２月までの分で年末調整をすればいいのでしょうか？本人は、今年も確定申告をします、と言っているのですが。
よろしくお願いいたします。

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既にyayoi16さんがお書きになられている通りで、会社には年末調整する義務がありますので、確定申告される場合であっても、会社としては年末調整すべきこととなります。

ただ、１月の収入が給与であれば、源泉徴収票を提出してもらわなければ正しい計算ができませんので、その提出がなければ会社では年末調整ができない事となります。
http://www.taxanswer.nta.go.jp/2674.htm

既にyayoi16さんがお書きになられている通りで、会社には年末調整する義務がありますので、確定申告される場合であっても、会社としては年末調整すべきこととなります。

ただ、１月の収入が給与であれば、源泉徴収票を提出してもらわなければ正しい計算ができませんので、その提出がなければ会社では年末調整ができない事となります。
http://www.taxanswer.nta.go.jp/2674.htm

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