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そもそも税込経理では仮払消費税と仮受消費税は必要ないのではありませんか？
税別経理なら例えば

消耗品費 100＋仮払消費税 5／現金 105 の仕訳が必要ですが、

税込経理では　

消耗品費 105／現金 105

となり、弥生会計がこの仕訳から自動で消費税申告書を作成してくれます。私は税別しか知りませんので税込の場合の決算時の処理については詳しくありません。どなたか弥生で税込を選択している方の回答に期待しましょう。

そもそも税込経理では仮払消費税と仮受消費税は必要ないのではありませんか？
税別経理なら例えば

消耗品費 100＋仮払消費税 5／現金 105 の仕訳が必要ですが、

税込経理では　

消耗品費 105／現金 105

となり、弥生会計がこの仕訳から自動で消費税申告書を作成してくれます。私は税別しか知りませんので税込の場合の決算時の処理については詳しくありません。どなたか弥生で税込を選択している方の回答に期待しましょう。

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(3期の最終データと4期始めのデータが一致しない事が分かりました。)

これは一致しません。

（3期目の最後で「仮払消費税」と「仮受消費税」は「税抜試算表」だと残高￥0になっているのですが、4期始めの税抜試算表の「前期繰越」欄を見ると、「税込試算表」と同じ数値が入っていて、￥0になっていないのです。）

３期目の最後の税抜試算表の仮払、仮受消費税の残高は0になっているとのこですが、これは自動集計では0には絶対なりません。
税抜経理では仕訳を計上して0にします。税込経理をしている以上、仮払、仮受消費税の仕訳は計上しませんので、税抜試算表上は一年分の仮払、仮受消費税の合計が表示されます。

そしてこれを更新すると期首の仮払、仮受消費税額は自動的に残高0になり税込経理の期首残高と一致する仕組になっています。
従って税抜試算表の３期末と４期首の残高は違うのです。

この仕組みを念頭にもう一度念査されては如何でしょうか。

(3期の最終データと4期始めのデータが一致しない事が分かりました。)

これは一致しません。

（3期目の最後で「仮払消費税」と「仮受消費税」は「税抜試算表」だと残高￥0になっているのですが、4期始めの税抜試算表の「前期繰越」欄を見ると、「税込試算表」と同じ数値が入っていて、￥0になっていないのです。）

３期目の最後の税抜試算表の仮払、仮受消費税の残高は0になっているとのこですが、これは自動集計では0には絶対なりません。
税抜経理では仕訳を計上して0にします。税込経理をしている以上、仮払、仮受消費税の仕訳は計上しませんので、税抜試算表上は一年分の仮払、仮受消費税の合計が表示されます。

そしてこれを更新すると期首の仮払、仮受消費税額は自動的に残高0になり税込経理の期首残高と一致する仕組になっています。
従って税抜試算表の３期末と４期首の残高は違うのです。

この仕組みを念頭にもう一度念査されては如何でしょうか。

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efu様、boo様、ご返信ありがとうございました。
結局、消費税設定の経理方式を「税抜」に変更し、今後の処理をして行く事になりました。
課税事業所になってから初めての決算後の事だったので、消費税処理は分からない事が多くてちょっと大変でしたが、これで様子を見ようと思います。
ついでに弥生会計のバージョンアップとサポート契約も行いました。
また何かありましたらご質問させて頂きます。
よろしくお願いします。

efu様、boo様、ご返信ありがとうございました。
結局、消費税設定の経理方式を「税抜」に変更し、今後の処理をして行く事になりました。
課税事業所になってから初めての決算後の事だったので、消費税処理は分からない事が多くてちょっと大変でしたが、これで様子を見ようと思います。
ついでに弥生会計のバージョンアップとサポート契約も行いました。
また何かありましたらご質問させて頂きます。
よろしくお願いします。

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