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当社では給与はすべて社長が計算から支払いまでしているのですが、所得税の計算を控除額を差し引いた金額からではなく総支給額から計算しているようなのです。
翌月の給与で差額を戻してもらったほうがよいのでしょうか？
それとも年末調整とかで戻ってくるのでしょうか？　
とても困っています教えてください。

当社では給与はすべて社長が計算から支払いまでしているのですが、所得税の計算を控除額を差し引いた金額からではなく総支給額から計算しているようなのです。
翌月の給与で差額を戻してもらったほうがよいのでしょうか？
それとも年末調整とかで戻ってくるのでしょうか？　
とても困っています教えてください。