こんばんは。

>タクシー代はホテルのほうで立て替えて、タクシー会社に支払い

このようなケースは、サービスの一環としてよくあるケースと
思います。
請求書にタクシーの領収証のコピーを添付し、「○○様タクシー代立替分」とでもすれば良いでしょう。

領収証も、請求時と同様 「○○様タクシー代立替分」とすれば問題は無いと思いますよ。