＞振替伝票をたまに書いてくれるのですが領収書が無くて・・・その事を言うと「絶対全部、渡したはずだ！」とまるで無くしたかのような態度とられます・・・

精算の都度、領収書を確認する必要があります。後から「無い」と伝えてもトラブルが生じるだけです。

社長に対する貸付金は、税務調査で指摘されやすい項目です。早めに会計士に相談してくださいね。