こんにちは。

郵便局が再発行してくれるかどうかは、その郵便局にお尋ね頂くしかないでしょうね。

そしてもし再発行が不可能となれば、内容・金額・日付・郵便名などを書いたものを作成し、紛失した状況も書いて、
上司の承認印を頂き、それを証拠として経理処理するしかないですね。
金額が大きくなければ税務調査でもあまり問題にはならないと思います。