皆様ありがとうございました!
うちはもともと普通に繰り越していたんですが、最近になって増えた新しい取引先のいくつかから、重複入金が続いたものですから心配になってご相談した次第です(笑)。
これらのところに対しては、お知らせの文書を付けて知らせるなどの方法で対処してみることにします。