こんにちは。

＞給与から差し引くとなると、源泉税を引く前の
金額を前月調整分等で差し引けばよろしいのでしょうか？

それで宜しいと思いますよ。

但し上でお書きの
＞正しい金額が\5,250-低い金額とした場合、

それが外交員報酬の支給額の過払い分であれば、
販売手数料　\248,154-　　/　普通預金　　\223,339-
　　　　　　　　　　　　　/　源泉税　　　\24,815-
というようになりませんでしょうか？？

お書きの仕訳ですが（なんか数字が変？貸借不一致）
＞販売手数料　\253,404-　　/　普通預金　　\228,064-
　　　　　　　　　　　　　/　　源泉税　　　\25,304-
この源泉税は25,340が正しいですよね？・・きっと入力違いかと。。。

だとすると他の給料仕訳の中で
源泉税　525（25,340−24,815)/ 販売手数料　5,250
の仕訳を含めれば良いと思うのですが。　

平成21年分の年末調整の話ですが、この過払いは1月支払いでのことでしたでしょうから、お書きの通りで宜しいとは思いますが。

なんだかスッキリしない回答で大変申し訳ございません。

もし違っていましたら、どなたかご明晰の方、フォロー何卒お願い致します！！