分かる範囲だけですが

(1)返還されないものを記入します。
  預り金は退去時に返還されるでしょうから除きます。
  支払調書は全て税込で記入します。

(2)うちの場合は家賃と共益費は合算して1行で→家賃
  仲介手数料は仲介者に払うものなので下の「あっせん手数料」になります。
  敷引きの制度は知らないのでよく分かりません。ごめんなさい。
 
(3)契約書を誰と交わしているか。を見てください。

(4)火災保険は支払調書には関係しません。