basso様、ありがとうございます。

absso様のおっしゃる通り、「立替金」でできると気持ちスッキリです。
ただ、今回の処理にあたり、実際にお客様へ商品を受け取りにいったり、廃棄業者へ持ち込んだりといった手間分を手数料をいただく形で請求したいのです。
実際に廃棄業者へ支払った金額に手数料を上乗せしてお客様に請求書を発行します。

この場合、
雑入と立替金を相殺　　　雑入　／立替金
で金額がゼロにならないですけど、手数料分が雑収入で計上されるという認識で良いでしょうか？