生命保険料控除証明書を直接見ているわけではないので判断はできませんが、証明書をよ〜く見ると「一般の生命保険料控除用」や「個人年金用」と記載されている場合があります。
その様なはっきりとした記載が無くても、「生命（一般）」「年金」などの記載がありますので、確認してみてください。

契約に「生命（一般）」や「生命」等の記載がある場合は『一般の生命保険料』

契約に「個人年金」や「年金」等の記載がある場合は『個人年金保険料』

どうしても判断が付かない場合は、証明書を提出したご本人に確認した方が無難かと思われます。