ずいぶん前のレスに書き込みで申し訳ありません。
読んでいて気になったもので…

motamotaさんが二級建築士をお持ちなら当然経審に反映させるべきだと思います。ですが、経審申請時に技術者名の追加記入をしても、反映されません。

例えば、決算期平成18年4月1日〜平成19年3月31日であればその期中に
ただの技術者であれば「国家資格者等・管理技術者一覧表」で追加申請
専任の技術者であれば「専任技術者証明書」で追加か新規で申請を都道府県にしなければ平成18年度の決算時の経審には反映されません。入札参加申請をしていれば、そちらも「技術者名簿の変更届」をしなければなりません。

なので今、経審の申請の準備をしているのであれば、今回の経審での追加はできません。

会社の上司の方と都道府県の所轄の土木事務所に相談確認してみてください。