弥生会計を使用されてるんですね。

そのソフトはあまり詳しくなりませんので・・・困りましたね。

>不動産売上原価の科目は仕入に作成していいのでしょうか?

はい。当期商品仕入で良いのではと思います。

>うちでは今のところ土地の転売が多くを占めています。

棚卸資産の所に商品、半製品などありますが、そこを販売用土地
と名称変更で良いかと思いますがどうでしょうか!

いずれにしても大変でしょうけど頑張って下さいね。
近くに詳しい方がいれば心強いでしょうけどね。