その返却してもらえない理由によります。

（1）倉庫を返した際の原状回復費用として取られてしまったのでしたら、まあ、修繕費（修理代）にでもすればよいと思います。

（2）本当は請求すれば返してもらえたのに、めんどくさがって請求しなかったために返してもらえなくなったのでしたら、それは必要経費にはなりません。

（3）相手が夜逃げでもして回収不可能になったのでしたら、それもしょうがないので雑損失にでもしてしまいましょう。

まあそれほど巨額ではないので、適当に修繕費（修理代）あたりにしておけばよいかと思います。