ちょっと分かりにくい文章になってしまって
余計な心配をおかけしてしまったかもしれませんが、
結論としては、証憑として特に問題ないと思いますので、
「いい加減」くらいの扱いでいいと思いますよ。

調査で印紙のない領収書が見つかると、
その会社の落ち度ではないにせよ
結果的に余計な時間がかかる可能性も一応あるので、
手すきのときにでも店長辺りと話をされては、
くらいの話です。

そんなに気にされないで下さい。