私も心配なので、手計算プラスフリーソフトを利用しました。

”nencyou”で検索すると、年末調整用のフリーソフトが
いくつかありました。(必ず平成18年版を選んでくださいね)

両方の計算がピッタリ合っていると安心です。 :-D