確かに移設作業だけで400万円というのは高いですね。サーバーの付加価値の増加はないということであれば、サーバー機器事態の撤去・移設費用ならびに再設定費用(これが結構高額になるんですよね)だと思われるので一括費用として処理して問題ないと思います。