オフィスビルのような、建物全体の設備プラス各部屋への給気設備という
構成なのか、それとも単に各部屋専用の独立した空調機器×６セットなのか、
によって違ってくると思います。（前者＝全体で判定、後者＝各セットごとに判定）
アパートでしたらおそらく後者だと思うのですが、
全体で50万円という証憑だけでは個々の取得費用が
等しくその６分の１なのかどうかはわかりませんので、
全額を取得した年の経費として処理するためには
部屋ごとの金額が見えるような形で
見積書／納品書／請求書等をもらっておいた方が
より安全だと思います。