ありがとうございました。
まだ、前途多難です(苦笑) 
今日税理士に相談したら、やはり自分で用紙記入して、捺印までして、会社の人に頼んで出してもらうのが良いと言われて、いろいろ教えてもらいました。
 会社に提出だけ依頼したところ、じゃあ、一緒に手続きについてきてと言われ絶句した次第です。

 所轄事務所などに直接質問して、自分で出来るなら終わらせてしまったほうが早そうです。