原則的には更正の請求をします
前年  未収入金/売上 の重複計上分として
税金の還付の請求をします

金額が少ないなら今年の申告で

雑損失(過年度修正)/ 未収入金
で処理しますが、税務署の調査が来た時には
もう更正の請求が出来ません(確定申告から1年以上経過のため)
税務署が黙認してくれるかは、わかりませんから
更正の請求をした方がいいとおもいます

参照
http://www.taxanswer.nta.go.jp/2026.htm