たとえば5万円の支払ならば
経費科目○○ 50,000  /  現金 50,840
振込手数料    840

の仕分けが手数料相手方負担の場合
経費科目○○ 50,000 / 現金 50,000
で終了。振込依頼書(銀行提出の振込表)の振込金額には
手数料を差し引いた振り込み金額を記入してます。 :-)