bieriさん　こんにちは

私もあまり経験のある方ではありませんので、自信はありませんが・・・少しでも参考になれば幸いです。

「フランチャイズの加盟金の仕訳を教えてください」

金額や内容によるのかもしれませんが、税法上は繰延資産（償却期間５年）に該当するようです。
http://www.nta.go.jp/category/tutatu/shitsugi/houjin/06/02.htm

　ですから、今期首に支払ったとすると

　長期前払費用５００／現預金５００

（決算時）
　繰延資産償却１００／長期前払費用１００


「毎月のロイヤリティの科目は何になるのでしょうか・・」

　「ロイヤリティ」という科目を作っても良いと思うのですが、
「管理費」に持っていくのがいいのでは！！

　ちなみに、ロイヤリティの消費税は課税のようですね。
http://www.nta.go.jp/category/tutatu/shitsugi/syouhi/02/28.htm


　　　間違えていたら、誰かツッコんで下さい！！！