いろいろアドバイスありがとうございます。
今年はこのままでパート先に何も言わないとして、
来年の1月には扶養控除申告書は出せないという事ですよね。
月に1万〜2万弱しか支払わないのに乙欄で源泉徴収するのは企業としては面倒な事でしょうか?
延滞税等も関わるなら、パート先に迷惑をかけてしまいますし・・・
とりあえずはパート先に相談してみようと思います。