tontontonさん、こんにちは。

この従業員の方は、実家のある大阪に移り住んでるという事ですが
転勤という事ですか?
それとも退職するにあたってなのでしょうか?

実家か通勤できる範囲の事業所に転勤となって、今は引継ぎの為にだけ
名古屋に来てるのであれば、出張という形を取ってかまわないと思いますよ。
当然、給与ではなく出張費という形で処理しても良いと思います。

何故、そのような形になったのかによって、処理は変わってくるでしょうし
旅費を会社が負担すべきなのかという事にもなると思いますよ。