結果的に売上計上が間違っていたのですから、前期損益修正損
でしょう。
金額にもよると思いますが。
金額が小さく無視できる範囲なら売上のマイナスでもいいと
思います。

とその前に、そもそも売上の計上のしかたに問題はないの
でしょうか?
「仕事がボツになったと判明するまでに時間が少々かかる」
のに、どのタイミングで売上を計上するのでしょうか?
確定していない売上を計上することはできないと思うのですが。
請求しても平気で払ってもらえないことがあるのが業界の
慣習なのでしょうか?
どういう契約で仕事を請け負っているのでしょう。