bajilさんこんにちは☆

会社として車両に関する規則を作成されるか、または私有車公用使用契約などの文面で契約書・覚書など締結されてはいかがでしょうか？その中で補助範囲・損害補償範囲などの条項を定めれば宜しいかと思います。

あと、ガソリン代算出の関係では運転日報(業務内容・行き先・走行距離など)を作成・提出していただいた方が宜しいと思います。

なお、出退勤途中などは微妙なところですが、業務に使用中に万一事故に遭遇された場合であれば会社負担(労災)となるのではないでしょうか。労務に関してはうといのですみませんが詳しくご説明できませんm(_ _)m

説明下手ではありますが、ご参考まで★