教育を開始するときには、あなたの会社への入社が決まっていたの
でしたら、本人が授業料を立替払いしていたものを、研修のための
福利厚生費として精算したという経理ができるでしょう。

入社が決まっていなかったのでしたら、個人の授業料を会社で負担
することになり、給与課税が必要になろうかと思います。

消費税については、研修会社が国等の委託を受けた研修機関かどう
かで異なりますので、お問い合わせになってはいかがでしょう。
もちろん、賞与など給与課税となる場合は不課税です。