度々の回答ありがとうございます。

＞救いがあるとすれば、追加で納めた分の社会保険料はそのまま年末調整や確定申告で社会保険料控除の対象になりますので、追加で収めた分源泉所得税や住民税（次年度分）は少なく済むはずですよ。
そうなんですか？
そういうお話は会社からはなかったです。
従業員負担の分の含めて修正額全てをいったん会社で支払い、会社が立て替えた分を従業員が支払うそうなのですが、それでも年末調整の対象になるのでしょうか？