>パソコンで領収書(PDF)を保存していればいいだけなのでしょうか?

そうです、ただ失くした等を防ぐのに定期的にバックアップや控えを作る必要はあります。


>エクセルで索引簿、規定などの作成も必要なのでしょうか?

規程は電子取引データを扱う以上作成は絶対かと。索引簿はファイル名に年月日、取引先、取引金額を打つのが嫌という場合は作れば良いかと。

索引簿はあくまでも例えば,般樵阿良佞韻蕕譴殖丕庁謄侫.ぅ襪涼羶箸何なのかというのを表しているだけです、ファイル名に直接打ち込むのであれば必要はないでしょう。