どっちがいいかという話ですが、

どなたから聞いたかはわかりませんが、その人がおっしゃる通り最終的には１年間のきっちりとした数字がわかれば税金面の計算で困ることはありません。

貴方がただ単に税金の計算元になる数字さえあってればいいよという考えでしたら期末のみ未払金計上でよいと思います。