前期の仕訳を間違えた結果、
決算時の借入金残高が実際の残高と相違する場合には、
その残高を訂正するための仕訳を起こすことは可能ですが、
決算時の残高が合っていて仕訳のみ間違っている場合には、
今期中に訂正処理するのは出来ないのではないでしょうか？

但し、PC上補助コードなどを使用していて、
補助残が合っていないようなときは、
　　長期借入金（旧）300万円／長期借入金（新）300万円
のような仕訳を入れればよろしいかと。