返信ありがとうございます。
説明不足で申し訳ありません。

>それとも貴社でただ単に軽油を引取税込みで買って関連会社に転売しただけなのでしょうか?

こちらに該当します。
仕入先からの請求書には軽油税が別途記載されており、関連会社へ転売する際も軽油税を別途記載しています。

よろしくお願いいたします。