間違った金額が1,000円だとすると、
期首に 法定福利費 / (社会保険料)預り金 
       1,000           1,000
の仕訳を入れて正常に戻すか、
もしくは、
社会保険料支払い時に、
     法定福利費 / 現預金(現金、当座預金など)
        2,000      2,000
      (うち1,000円は会社負担分、 残り1,000円は従業員自己負担分)
 と処理するか。
前期の決算書の法定福利費の年間合計金額が今回間違った金額分マイナスに
なっている(費用が少なく計上され、利益がその分増えている)と思います。
今期では逆に費用が多く計上されてしまいますね。