こんにちは。

>口座に取引先から間違って、私共の売上ではないものが入金されて、送金し直したのですが(振込手数料はこちらで負担しました。)帳簿上ではどう処理していいのか分からず困っています。どなたか教えてください。

間違って入金されたとき(100としますね)
預金100/仮受金100

返金したとき(振込手数料は10とします)
仮受金100/預金110
支払手数料10

>あと、もうひとつ、共同経営で売上が私達の口座に入金された場合、相手に取り分をわたす際の仕訳はどうなるんでしょうか?重ねてお願い致します。

各事業者が共同で第三者と取引をしたということですよね。
入金したとき
預金100/売上50
     預り金50

パートナーへ渡したとき
預り金50/預金50

ほかの方法も考えられますが、上記の方法もあります。
あと、消費税は考慮していません。