質問受けとしても悩ましい案件ですね。

売上形態があいまいだと、
50％の配分の根拠が問題になるでしょう。
10万円の商品売上の内訳が、A社で仕入れた商品50％、
B社で仕入れた商品50％なら、�△任いい茲Δ忙廚┐泙后�
同じ商品をＡ社で仕入、Ｂ社でも仕入たが、
売った商品の内訳が不明だから一律に５０％にしたとなれば、
仕訳の方法にかかわらず、A社50%、B社50%で分ける理由が問われると思います。
経費の折半もないので説得力に欠ける話になるのかもしれません。