青色申告決算書の消耗品費欄　99,000円
e-taxの表イ-１の消耗品費欄　99,000円
であれば、まず正解です。

要は、表イ-１の消耗品費欄で、
決算額欄が、99,000円、
課税取引にならないもの欄が、ー11,000円、
課税取引金額欄が、110,000円、
となっていれば、正しく消費税控除が出来るはずです。
（99,000円＝110,000円-11,000円）
なぜなら、決算額ではなく、課税取引金額をもとに消費税控除を計算するからです。