貯蔵品 / 消耗品費(不課税)
の仕訳を入力した結果、表イ-1がどのように出力されているかですね。
入力が正しく反映されているのなら、変更入力は不要かと?

もちろん、消耗品の消費税は購入した年に控除します。
表イ-1の決算額は、青色申告決算書の数値と一致します。
課税取引金額が決算額より多くなり(貯蔵品に振り替えた金額を加算したもの)、
課税取引にならないものは、その分マイナス表示にならないといけません。
(やよいの青色申告がそこまで調整できるどうかはよくわかりません)