efu様、ご回答頂きありがとうございます。
単純に特に届け出等をしていなかった事と、計算が楽という事もありまして、
使用しておりました。利益に関しては恥ずかしながらほぼない状態となっております。
原価の方の計算の仕方の方は合っているとの事で安心したのですが、
原価がマイナスの状態になる事は通常ありえるのかどうか知りたく質問させて
頂きました。