こんにちは。

>注文、請求書発送先、雑誌発送先は、日本国内です。

ということは、完全に国内取引ですから消費税の課税対象ですよね。
その返金ですので、お考えの通り課税取引扱いで宜しいのです。

お書きの場合に、顧客の中で代金の授受に関して、
たまたま海外銀行を使用している というだけのことかと思います。
例えば、在日外国人さんなど。。

海外銀行だから という点が重要ではなく、
その顧客が日本で購読(消費)しているのかどうかが、消費税課税のポイントになりますね。